GENÓMICA Y EVOLUCIÓN MOLECULAR

Dr. Víctor M. Valdés López

M. en C. Alfonso José Vilchis Peluyera

Biól. Bibiana Rodríguez Ponce

Líneas de Investigación:

  1. Genómica y Evolución Molecular (Biología Molecular in silico).
  2. Análisis Computacional de Bases de datos
  3. Identificación y análisis de genes y retropseudo genes de varias familias multigénicas en el genoma humano.
  4. Paleo-microarreglos: Detección de cambios en los niveles de expresión en el pasado e respuesta a presiones de selección antiguas.
  5. Filogenia molecular de secuencias no codificantes, como marcadores moleculares de la evolución de genomas eucariontes en particular el genoma humano.
  6. Identificación y análisis de marcos de lectura abiertos, potencialmente codificantes, en los genomas de eucariontes unicelulares (Saccharomyces cerevisiae y otras levaduras incluyendo a la levadura marina halotolerante Debaryomyces hansenii).
  7. Anotación y análisis evolutivo, filogenético y funcional del genoma de Taenia solium. Participación en el consorcio de secuenciación del genoma de Taenia solium. Proyecto IMPULSA (03), UNAM.

PROYECTOS

Análisis de pseudogenes y retropseudogenes en el genoma humano y del ratón. Víctor M. Valdés López, Alfonso Vilchis, Bibiana Rodríguez, Luisa Alba, Beatriz Rodarte, Claudia Segal, 2005.

Análisis Filogenético y Evolutivo de Retropseudogenes de HSP60 y HSP10. Alfonso Vílchis Peluyera, 2005.

Análisis Genómico y Evolutivo de retropseudogenes en el genoma humano. Victor Valdés López, 2004.

Estabilidad, mecanismo de cierre y farmacología de canales de potasio operados por voltaje. IN216503-2. Enero, 2004 – diciembre, 2005. Froylán Gómez Lagunas (Responsable) Víctor M. Valdés López (Co-responsable).

Estabilidad, mecanismo de cierre y farmacología de canales de potasio operados por voltaje. IN216503-2. 2005. Gómez Lagunas Froylán, Víctor M. Valdés López.

Control post-transcripcional en cloroplastos. IN225001. Septiembre, 2001 – septiembre, 2003. Heminia Loza Tavera (Responsable), Víctor M. Valdés López (Co-responsable).

ARTICULOS

Valdés-López, V.; Vilchis Peluyera, A.; Alba Lois,L.; Rodarte, B.; Segal Kischinevsky, C.; Rodríguez Ponce, B.; L. D. Alcázar Peraza. 2004. Evolución Genómina: Aparición y divergencia de retropseudogenes. Scientific American. Edición Latinoamérica (Sección Ciencia y Sociedad). Scientific American Latinoamérica, pp. 32-33.

Aguilar-Díaz, H., Bobes, R. J., Carrero, J. C., Camacho-Carranza, R., Cervantes, C., Cevallos, M. A., Dávila, G., Rodríguez-Dorantes, M., Escobedo, G., Fernández, J. L., Fragoso, G., Gaytán, P., Garciarubio, A., González, V. M., González, L., M. V. José, Jiménez, L., Laclette, J. P., Landa, A., Larralde, C., Morales-Montor, J., Morett, E., Ostoa-Saloma, P., Sciutto, E., Santamaría, R. I., Soberón, X., De la Torre, P., Valdés, V., Yánez, J. 2005. The genome project of Taenia solium. Parasitology International 5: S127-130.

Avendaño, A., Riego, L., DeLuna, A., Aranda, C., Romero, G., Ishida, C., Vazquez-Acevedo, M., Rodarte, B., Recillas-Targa, F., Valenzuela, L., Zonszein, S. & Gonzalez, A. 2005. Swi/SNF-GCN5-dependent chromatin remodelling determines induced expression of GDH3, one of the paralogous genes responsible for ammonium assimilation and glutamate biosynthesis in Saccharomyces cerevisiae. Mol Microbiol. 57 (1): 291-305.

EN PRENSA

Vilchis Peluyera A. y Valdés López, V.: La Biotecnología Vegetal. Pasado, Presente y Futuro. En "Biología de Angiospermas". Editoras: Judith Márquez y Margarita Collazo. Facultad de Ciencias, UNAM. (2008).

Vilchis Peluyera, Alfonso., Rodríguez Ponce Bibiana y Valdés López Víctor.: Proyecto Genóma Humano y su importancia para la antropología física. En "La Complejidad de la Antropología Física" . Editores: Barragán Solis, A. Y González Quintero L. Escuela Nacional de Antropología e Historia (2008

CAPITULO EN LIBRO

Valdés V., A. Vilchis y L. Alba. 2004. Paisajes Genómicos. Capitulo II 31-49 En: Velásquez, A. (coord.) Lo que somos y el genoma humano desvelando nuestra identidad. Ediciones Científicas Universitarias (ISBN 970-32-1663-3) y Fondo de Cultura Económica (ISBN 968-16-7321).

Valdés-López, Víctor.: BIOLOGÍA MOLECULAR, EVOLUCIÓN Y GENÓMICA Cap. 30; pp 215 - 235. En: Ana Flisser Steinbruch y Ruy Pérez Tamayo (Coord.) "Aprendizaje de la parasitología basado en problemas". Editores de Textos Mexicanos (ETM). ISBN 968 – 5610 – 43 – 6. 2006.

Valdés-López, Víctor.: PROBLEMAS DE BIOLOGÍA MOLECULAR Cap. 3; pp 15 – 19. En: Ana Flisser Steinbruch y Ruy Pérez Tamayo (Coord.) "Aprendizaje de la parasitología basado en problemas" Coordinadores Editores de Textos Mexicanos (ETM). ISBN 968 – 5610 – 43 – 6. 2006.

Libro

Jiménez García Luis Felipe, Segal Kischinevzki Claudia y Valdéz López Víctor (Compiladores). DNA 50 AÑOS. Las Prensas de Ciencas. 2008

Material de Difusión

Valdés-López, Víctor. El modelo de Watson y Crick a 50 años de distancia. Suplemento INVESTIGACIÓN Y DESARROLLO. La Jornada. Marzo, 2003.

Valdés-López, V., Vilchis-Peluyera, A., Alba-Lois, L., Rodarte-Murguía, B., Segal-Kischinevzky, C., Rodríguez-Ponce, B. y Alcaraz-Peraza, L. D.: GENÓMICA COMPARADA Y EVOLUTIVA. EVOLUCIÓN MOLECULAR Y PALEONTOLOGÍA MOLECULAR DEL GENOMA HUMANO. Memorias del Primer Coloquio: La Ciencia desde la Facultad de Ciencias. (CD). Septiembre, 2003.

Valdés-López, Víctor M., GUIÓN PARA UNA NOVELA DE CIENCIA FICCIÓN. Revista de la 2ª Semana de Ciencia Ficción. Colegio de Ciencias y Humanidades, Plantel Sur. Abril, 2004.

Valdés-López, Víctor: CONTRAPORTADA DEL LIBRO "LA VIDA MISMA: SU ORIGEN Y NATURALEZA" de Francis Crick. Editado por el Fondo de Cultura Económica (2005).

Valdés-López, Víctor.: GENES Y GENOMAS EN EL TIEMPO. Revista electrónica del Posgrado de la UNAM: Pluralitas. Año 4. No. 3. Abril – Mayo, 2005.

TESIS DIRIGIDAS Y FINALIZADAS

Licenciatura

Rodríguez Ponce Bibiana. Biología. Facultad de Ciencias, UNAM. Titulo de la Tesis: "Los Retropseudogenes de Arginnosuccinato Sintetasa en el Genoma Humano. Análisis genómico y evolutivo". Fecha de Inicio: Noviembre 2002. Fecha de examen: Enero, 2007. Director: Víctor M. Valdés López

Maestría

Vilchis Peluyera Alfonso José. "Análisis Evolutivo de Retropseudogenes de las Familias de Proteinas de Choque Térmico HSP10 y HSP60 en el Genoma Humano". Maestría en Biología Experimental. Facultad de Ciencias, UNAM. Fecha de inicio: abril, 2002. Fecha de examen, Febrero 2006. Director: Víctor M. Valdés López.